La campaña 1998-99 le trajo gloriosos trofeos de copa al Valencia, ya que Los Che se aseguraron la Copa del Rey, culminando en una dramática victoria en la Final sobre el Atlético de Madrid. Liderando la ofensiva estuvo el sensacional Claudio López, cuyos 21 goles resultaron decisivos en una temporada construida sobre un emocionante estilo de ataque y una memorable trayectoria hacia el trofeo. Fue un año fundamental que aseguró un crucial cuarto puesto en La Liga, sentando las bases para una era dorada en la historia del club. La campaña 1999-00 significó una temporada histórica para el Valencia, ya que Los Che, bajo la dirección técnica de Héctor Cúper, lograron un sólido tercer puesto en La Liga y disfrutaron de una impresionante trayectoria hasta la final de la UEFA Champions League. Liderando el ataque estuvo el inspirador capitán Gaizka Mendieta, cuyos 13 goles en liga (y 19 en todas las competiciones) impulsaron el implacable empuje del equipo. Esta dramática trayectoria los vio aplastar al Barcelona por 4-1 en las semifinales antes de caer ante su rival Real Madrid en la final, la primera final totalmente española de la competición, una derrota desgarradora que fue mitigada por el premio a Mendieta como el Mejor Centrocampista Europeo de la Temporada.