La temporada 1999-00 vio al Wolfsburg continuar su impresionante ascenso en el fútbol alemán, con Die Wölfe asegurando un sólido séptimo puesto en la Bundesliga bajo la dirección del entrenador Wolfgang Wolf. Este rendimiento constante en la liga se vio reforzado por una memorable campaña europea hasta la tercera ronda de la Copa de la UEFA, donde se enfrentaron célebremente al Atlético de Madrid. Liderando la ofensiva estuvo el prolífico delantero nigeriano Jonathan Akpoborie, cuyos 12 goles en liga resultaron decisivos en una temporada construida sobre la garra de un plantel que contaba con Andrzej Juskowiak y Charles Akonnor. Fue un año destacado que confirmó el estatus del club como una fuerza competitiva en la máxima categoría y sigue siendo un capítulo definitorio en su temprana historia en la Bundesliga.