La campaña 2000-01 fue una temporada clave que le dio a Lyon su primer trofeo importante en 28 años, ya que Les Gones se quedaron con el título de la Copa de la Liga con una memorable victoria por 2-1 en la final sobre su rival Mónaco. Bajo el mando del nuevo entrenador Jacques Santini, el equipo también luchó intensamente por la liga, terminando finalmente en un sólido segundo puesto en la División 1 y asegurando la clasificación para la Liga de Campeones. Al frente de la ofensiva estaba el prolífico talismán brasileño Sonny Anderson, cuyos 22 goles en liga resultaron decisivos en una campaña que marcó el fin definitivo de la sequía de títulos del club y sentó las bases para su futura era de dominio francés.