La campaña 2000-01 vio al VfL Wolfsburg establecer firmemente su presencia en la Bundesliga, con Die Wölfe asegurando un respetable 9º puesto y un lugar en la Copa Intertoto. Liderando la ofensiva estuvo el clínico delantero polaco Andrzej Juskowiak, cuyos 12 goles en liga fueron vitales en una temporada definida por el estilo ofensivo y una formidable diferencia de goles. Los momentos destacados incluyeron una espectacular demolición por 6-0 del FC Köln y un emocionante empate 4-4 contra el Hamburgo, marcando una temporada de crecimiento constante bajo el mando del entrenador Wolfgang Wolf que sigue siendo un capítulo clave en los primeros años del club en la máxima categoría. La campaña 2001-02 vio al Wolfsburg asegurar un sólido 10º puesto en la Bundesliga, manteniendo su estatus como una fuerza competitiva en la máxima categoría alemana. Liderando la ofensiva para Die Wölfe estuvo el prolífico delantero croata Tomislav Marić, cuyos 12 goles en solo 17 apariciones resultaron decisivos, incluyendo una racha histórica de cuatro dobletes consecutivos. Bajo la dirección del entrenador Wolfgang Wolf y con jugadores clave como Martin Petrov y Diego Klimowicz, fue una temporada de garra y actuaciones memorables que solidificaron la posición del club entre la élite.