La campaña 2001-02 trajo una temporada de consolidación en la mitad de la tabla, consistente aunque un poco frustrante, para el Atalanta, ya que La Dea terminó en un respetable 9º puesto en la Serie A. Al frente de todo el esfuerzo estuvo el influyente mediocampista creativo Cristiano Doni, cuyos sensacionales 16 goles cimentaron su estatus de leyenda e igualaron el récord histórico de goles del club en la Serie A. Bajo la dirección del entrenador Giovanni Vavassori, el equipo luchó con ahínco, recuperándose de manera impresionante de un mal comienzo de temporada para escalar desde el 17º puesto y asegurar un lugar en la mitad superior de la tabla, incluso llegando a los cuartos de final de la Coppa Italia, en una temporada construida sobre la garra y el inigualable talento ofensivo de Doni.