La campaña 2005-06 fue finalmente una temporada decepcionante para la Sampdoria, ya que los Blucerchiati terminaron en el 12º puesto de la Serie A, sin poder cumplir con las altas expectativas generadas por su anterior quinto puesto. Aunque la temporada marcó un importante regreso a las competiciones europeas después de años de ausencia, la campaña se definió rápidamente por una temprana eliminación en la fase de grupos de la Copa de la UEFA y una salida en cuartos de final de la Coppa Italia. Liderando la ofensiva y asumiendo la carga de ataque estuvo el favorito del club, Francesco Flachi, cuyos cruciales 11 goles en liga resultaron vitales en un año que no estuvo a la altura de las elevadas ambiciones del club.