La campaña 2005-06 fue una temporada de resurgimiento dramático y brillantez impactante para el Bayer Leverkusen, ya que Die Werkself luchó a través de la agitación inicial para asegurar un respetable quinto puesto en la Bundesliga, lo que les valió un lugar en la Copa de la UEFA. La campaña estuvo definida por la impresionante forma de clase mundial del delantero búlgaro Dimitar Berbatov, cuyos 21 goles clínicos anclaron el ataque, incluyendo unos increíbles 15 goles anotados después del parón invernal. A pesar de un comienzo difícil que incluyó el despido del entrenador Klaus Augenthaler y una temprana y decepcionante eliminación de la Copa de la UEFA a manos del CSKA Sofía, el equipo, bajo la dirección del nuevo entrenador Michael Skibbe, mostró un notable espíritu de lucha. Su rendimiento en la segunda mitad fue formidable, sumaron más puntos que el campeón Bayern Múnich y consolidaron el estatus del club en la competición europea, marcando un capítulo definitorio de consistencia y la legendaria destreza goleadora de Berbatov. La campaña 2006-07 impulsó fuertemente al Bayer Leverkusen en Europa, ya que Die Werkself aseguró un quinto puesto en la Bundesliga, clasificándose para la Copa de la UEFA. La campaña estuvo definida por el implacable impulso ofensivo del delantero Andriy Voronin, cuyos 10 goles lideraron la tabla de goleadores, y la sensacional forma del veterano mediocampista Bernd 'Schnix' Schneider, cuya brillante técnica y asistencias líderes en la liga impulsaron al equipo. Bajo el mando del entrenador Michael Skibbe, el club realizó una profunda carrera hasta los cuartos de final de la Copa de la UEFA y fue testigo de la dramática y explosiva aparición del joven portero René Adler. Fue una temporada construida sobre garra, talento y la promesa de la juventud que consolidó su estatus como un contendiente europeo constante.