La temporada 2005-06 fue un período turbulento de lucha y resiliencia para el Everton, ya que The Toffees terminaron en el puesto 11 de la Premier League, sin poder consolidar el espectacular cuarto puesto del año anterior. Las eliminaciones tempranas de la Champions League y la Copa de la UEFA, sumadas a un período en la zona de descenso a finales de octubre, pusieron a prueba la determinación del club antes de que el equipo de David Moyes se recuperara. Al frente de la ofensiva estuvo el delantero James Beattie, cuyos 10 goles cruciales en la liga resultaron vitales para asegurar un puesto seguro en la mitad de la tabla. La temporada también es recordada con cariño como el emotivo capítulo final para el ícono del club Duncan Ferguson, cuyo retiro marcó el fin de una era en Goodison Park. La temporada 2006-07 significó un vital regreso al fútbol europeo para el Everton, ya que The Toffees, bajo la dirección de David Moyes, consiguieron un sólido sexto puesto en la Premier League para asegurar un lugar en la Copa de la UEFA. Liderando la ofensiva estuvo el fichaje récord del club, Andrew Johnson, cuyos 11 goles cruciales en la liga fueron el pilar del ataque, destacándose por anotar un doblete en la sensacional victoria por 3-0 en el derbi de Merseyside contra su clásico rival, Liverpool. La temporada, definida por las actuaciones incansables del Jugador de la Temporada Mikel Arteta, restableció con éxito el lugar del Everton entre la élite inglesa y sigue siendo un capítulo definitorio en la historia moderna del club.