La campaña 2005-06 le brindó una sólida clasificación europea al Hertha Berlín, ya que Die Alte Dame aseguró un respetable sexto puesto en la Bundesliga, obteniendo un lugar en la Copa Intertoto. Liderando la ofensiva estuvo el favorito de la afición brasileña, Marcelinho Paraíba, cuyos 12 goles y su característico estilo resultaron decisivos en una temporada construida sobre la amenaza ofensiva y la estabilidad doméstica. Fue un año que mostró el brillante talento individual de Marcelinho y sigue siendo un capítulo preciado en la historia moderna del club. La campaña 2006-07 fue una temporada de montaña rusa de aventuras europeas y consolidación para el Hertha BSC, con Die Alte Dame terminando en un respetable décimo puesto en la Bundesliga. El año comenzó triunfalmente, con el club asegurando la prestigiosa Copa Intertoto de la UEFA, obteniendo un lugar en la Copa de la UEFA. Liderando el ataque con su característica garra estuvo el brillante Marko Pantelić, cuyos 14 goles en liga resultaron vitales para el equipo. A pesar de una breve y decepcionante participación en la Copa de la UEFA, el equipo mostró resiliencia al llegar a los cuartos de final de la DFB-Pokal, lo que convirtió a este en un año estable que consolidó el estatus del club y brindó destellos de emoción a los fieles seguidores.