La temporada 2006-07 le brindó un fuerte impulso europeo al Bayer Leverkusen, ya que Die Werkself terminó en la quinta posición de la Bundesliga, clasificándose para la Copa de la UEFA. La campaña estuvo definida por el incansable empuje ofensivo del delantero Andriy Voronin, cuyos 10 goles lo convirtieron en el máximo goleador, y la sensacional forma del experimentado mediocampista creativo Bernd 'Schnix' Schneider, cuya brillante técnica y sus asistencias, líderes en la liga, impulsaron al equipo. Bajo el mando del entrenador Michael Skibbe, el club llegó a los Cuartos de Final de la Copa de la UEFA, y fue testigo de la dramática irrupción del joven arquero René Adler. Fue una temporada cimentada en la garra, el talento y la promesa de la juventud que consolidó su estatus como un contendiente europeo constante.