La campaña 2006-07 le dio una gloriosa copa al Doncaster Rovers, ya que los Rovers se quedaron con el EFL Trophy con una memorable victoria sobre el Bristol Rovers en la final en el Millennium Stadium. Liderando la ofensiva estuvo Paul Heffernan, cuyos 11 goles resultaron decisivos en una campaña construida sobre el éxito en la copa y una consolidación constante con un undécimo puesto en la League One. Fue un año dorado que marcó el momento inolvidable de gloria en la copa para el club y sigue siendo un capítulo definitorio en la historia moderna del club.