La campaña 2006-07 significó un regreso deslumbrante a la élite europea para el Toulouse, ya que Les Pitchouns, bajo la dirección del entrenador Élie Baup, aseguraron un espectacular tercer puesto en la Ligue 1 y un codiciado lugar en las eliminatorias de la UEFA Champions League. Liderando la ofensiva estuvo el recién fichado delantero sueco Johan Elmander, cuyos 11 goles resultaron decisivos en una campaña construida sobre el talento ofensivo y la garra. El momento cumbre de la temporada fue el inolvidable hat-trick de Elmander en la última jornada, en una victoria por 3-1 sobre sus rivales locales, el Bordeaux, un resultado que selló dramáticamente su mejor posición en la liga en décadas y que sigue siendo un capítulo emocionante en la historia moderna del club.