La campaña 2009-10 para el Besiktas, que comenzó como campeón defensor de la Süper Lig, brindó una temporada de consolidación a nivel nacional y drama europeo para las Águilas Negras. Aseguraron un cuarto puesto en la Süper Lig, quedándose por poco fuera de los tres primeros y asegurando la clasificación para la Europa League. Al frente del ataque estuvo el prolífico delantero brasileño Bobô, cuyos 12 goles en liga fueron el pilar de la ofensiva. La temporada sigue siendo memorable por una histórica victoria por 1-0 como visitante contra el Manchester United en la fase de grupos de la UEFA Champions League, un punto álgido que finalmente no pudo evitar su eliminación en la fase de grupos.