La campaña 2012-13 trajo un dramático resurgimiento en la segunda mitad para el Bristol Rovers, ya que Los Piratas lucharon por recuperarse de un comienzo desastroso, escalando desde cerca del fondo de la League Two para terminar en un respetable 14º puesto. El momento clave fue el regreso en diciembre del entrenador John Ward, quien inspiró al equipo a ganar 12 de sus últimos 23 partidos, alejándolos exitosamente del descenso. Liderando la delantera al principio de la temporada estuvo el jugador cedido Tom Eaves, cuyos 7 goles lo convirtieron en el máximo goleador de liga del club. Fue una temporada de supervivencia definitiva que aseguró su permanencia en la Football League y sigue siendo un testimonio de la lucha del equipo al final de la temporada.