La temporada 2013-14 mostró a Thomas Müller como el eje táctico de la campaña debut de Pep Guardiola en el Bayern Múnich, donde su versatilidad y movimiento único definieron el dominante doblete doméstico del club. Moviéndose sin problemas por toda la línea de ataque, el autodenominado Raumdeuter aportó 13 goles y 11 asistencias para ayudar a asegurar el título de la Bundesliga en tiempo récord, mientras que también anotó en la victoria por 3-2 en la final de la Copa DFB contra el Stuttgart. Esta época es recordada con cariño por la consistencia clínica de Müller y su habilidad para explotar los espacios en los momentos más importantes, consolidando aún más su estatus como un creador de juego de clase mundial durante un año histórico de títulos que también incluyó la Supercopa de la UEFA y el Mundial de Clubes de la FIFA.