La campaña 2016-17 significó una temporada de consolidación en la mitad de la tabla para el Morecambe, ya que "Los Camarones" terminaron en el puesto 18 de la League Two, asegurando una cómoda ventaja de cinco puntos sobre la zona de descenso en su décima temporada consecutiva en la cuarta división. Bajo la duradera dirección técnica de Jim Bentley, el equipo brindó momentos de emoción, incluyendo haber liderado brevemente la tabla de la League Two durante dos jornadas al principio de la temporada. Los máximos goleadores conjuntos fueron el emocionante joven talento Paul Mullin y el veterano ícono Kevin Ellison, ambos anotaron 8 goles ligueros cruciales en un año centrado en mantener su estatus profesional.