La campaña 2016-17 fue una temporada de gran ambición y de un doloroso casi logro para el Tranmere Rovers, con los Super Whites alcanzando un espectacular segundo puesto en la National League. Al frente estuvo el prolífico delantero Andy Cook, cuyos 23 goles resultaron vitales en una campaña basada en el dominio local, finalizando con unos increíbles 95 puntos. A pesar de esta formidable actuación en la liga, la temporada culminó en una aplastante derrota por 3-1 ante el Forest Green Rovers en la dramática final de los play-offs en Wembley, lo que les negó agónicamente el regreso a la English Football League. Fue un año de inmenso esfuerzo, sostenido por la amenaza ofensiva de Cook y James Norwood, que finalmente se convirtió en un capítulo doloroso pero definitorio en la batalla del club por recuperar su estatus en la Football League.