La campaña 2018-19 vio a Les Gones asegurar un crucial tercer puesto en la Ligue 1, garantizando su regreso a la fase de grupos de la Champions League. El ataque fue brillantemente liderado por el nuevo delantero centro, Moussa Dembélé, quien anotó 20 goles en todas las competiciones (incluyendo 15 en la liga) en su temporada de debut, reemplazando al ya salido Mariano Díaz. Bajo el mando del entrenador Bruno Génésio, un hito definitorio fue su memorable recorrido en la Champions League, que los vio asegurar una sorprendente victoria por 2-1 contra el Manchester City en la fase de grupos, antes de que su aventura terminara en los octavos de final contra el Barcelona. El año, que también contó con el excelente estado de forma del 'Jugador de la Temporada' Memphis Depay y fue consolidado por el gol de la victoria de Dembélé sobre la hora en el inolvidable Derbi contra el Saint-Étienne, marcó una temporada fundamental que continuó la larga racha de clasificaciones europeas del club.