La campaña 2009-10 vio a Los Chivos estabilizar su posición en la Bundesliga bajo la dirección del nuevo entrenador Zvonimir Soldo, asegurando finalmente un cómodo decimotercer puesto en un año de consolidación. La temporada estuvo marcada por el emotivo regreso del ídolo del club Lukas Podolski y una buena actuación que los llevó a los cuartos de final de la DFB-Pokal. Liderando el ataque estuvo el potente delantero esloveno Milivoje Novaković, cuyos 6 goles ayudaron a sostener la ofensiva en un año de transición para Los Chivos. A pesar de que a Novaković se le quitó la capitanía a mitad de temporada debido a una disputa con Soldo, el club logró su objetivo principal de mantenerse en la máxima categoría, sentando las bases para un crecimiento futuro.