La campaña 1990-91 resultó en una temporada dramática y, en última instancia, frustrante para el FC Bayern, ya que el Bayern Múnich terminó en un reñido segundo puesto en la Bundesliga, a solo tres puntos del campeón 1. FC Kaiserslautern. Liderando el ataque estuvo el prolífico delantero Roland Wohlfarth, cuyos 21 goles, que lo convirtieron en el máximo goleador de la liga, le valieron la Bota de Oro de la Bundesliga y resultaron vitales para el equipo. Esta turbulenta temporada, supervisada por el entrenador Jupp Heynckes, estuvo definida por una humillante eliminación en primera ronda de la Copa de Alemania ante un modesto equipo de cuarta división y una desgarradora eliminación en semifinales de la Copa de Europa a manos del Estrella Roja de Belgrado, gracias a un dramático autogol en el último minuto del capitán Klaus Augenthaler. Fue un año caótico en el que ganaron la Supercopa de Alemania, pero sigue siendo un capítulo doloroso y definitorio que marcó el fin de la era Heynckes.