La temporada 2015-16 significó un regreso turbulento pero finalmente exitoso a la tercera división para el Bury, ya que Los Shakers aseguraron un decimosexto puesto en la League One. Al frente estuvo el prolífico nuevo fichaje Leon Clarke, cuyos 15 goles en liga fueron vitales para consolidar su estatus en la liga, tan duramente ganado. Fue una temporada de nervios, marcada por una deducción de tres puntos y un bajón a mitad de temporada, pero resultó ser un capítulo decisivo en la lucha del club por restablecerse en las filas profesionales.