La campagne 1998-99 a apporté le triomphe national au Bayern Munich, le FCB, dirigé par Ottmar Hitzfeld, ayant décroché le titre de Bundesliga. L'attaque était menée par le puissant duo Carsten Jancker et Giovane Élber, qui ont chacun marqué 13 buts en championnat lors d'une saison bâtie sur une régularité implacable et un leadership expérimenté. Ce fut une saison de gloire quasi historique, car ils ont également remporté la Ligapokal et atteint la célèbre finale de l'UEFA Champions League, où ils se sont inclinés de façon cruelle 2-1 face à Manchester United après avoir concédé deux buts spectaculaires dans le temps additionnel, un match qui reste l'un des chapitres les plus marquants de l'histoire européenne du club.