La saison 1999-00 fut chargée pour le FC Metz, les Grenats ayant participé à quatre compétitions et terminant finalement à la 11e place de la Division 1. Le point culminant de la saison fut un parcours déterminé jusqu'à la finale de la Coupe Intertoto de l'UEFA, avant de s'incliner de justesse face à West Ham United. L'attaque était menée par l'attaquant vétéran Gérald Baticle, dont les 6 buts en championnat furent une contribution clé, au sein d'une équipe qui comptait des figures établies comme Sylvain Kastendeuch et des talents émergents comme Louis Saha. Ce fut une année de transition qui vit les Grenats atteindre une solide position en milieu de tableau et qui reste un chapitre marquant de consolidation dans leur histoire en première division.