La saison 1999-2000 a vu Wolfsburg poursuivre son ascension impressionnante dans le football allemand, les Loups obtenant une solide 7e place en Bundesliga sous la houlette de l'entraîneur Wolfgang Wolf. Cette forme constante en championnat a été renforcée par un parcours européen mémorable jusqu'au troisième tour de la Coupe UEFA, où ils ont affronté le célèbre Atlético Madrid. Le prolifique attaquant nigérian Jonathan Akpoborie a mené l'attaque, ses 12 buts en championnat s'avérant décisifs lors d'une saison bâtie sur la détermination d'une équipe comprenant Andrzej Juskowiak et Charles Akonnor. Ce fut une année exceptionnelle qui a confirmé le statut du club comme force compétitive dans l'élite et reste un chapitre marquant de leurs débuts en Bundesliga.