La saison 2000-01 fut celle de la rédemption ultime et d'un succès historique pour le Bayern Munich, qui réalisa un doublé Bundesliga et UEFA Champions League sous la direction de l'entraîneur Ottmar Hitzfeld. Le titre de Bundesliga fut remporté de la manière la plus dramatique, grâce au coup franc de dernière minute de Patrik Andersson contre Hambourg lors de la dernière journée, assurant le championnat et anéantissant les espoirs de Schalke 04. Si les 15 buts en championnat de l'attaquant brésilien Giovane Élber furent essentiels, le moment clé de la saison fut le triomphe en Ligue des Champions, qui ramena enfin la Coupe d'Europe à Munich après 25 ans. Porté par le noyau légendaire d'Oliver Kahn et du capitaine Stefan Effenberg, le FCB se fraya un chemin jusqu'à la finale, éliminant au passage les deux précédents vainqueurs de la Ligue des Champions, Manchester United et le Real Madrid. En finale, le Bayern battit Valence 5-4 aux tirs au but après un match nul tendu (1-1), les exploits de Kahn et le penalty d'Effenberg effaçant la douleur de la défaite en finale de 1999. Ce fut une année en or qui consolida le statut de l'équipe en tant que rois d'Europe et demeure un chapitre marquant de l'illustre histoire du club.