La saison 2003-04 fut une campagne de frustration et d'occasions manquées pour le Borussia Dortmund, les Schwarzgelben terminant finalement à une décevante 6e place en Bundesliga, ne décrochant qu'une place en Coupe Intertoto. Les difficultés de la saison furent fortement ressenties en raison de l'absence prolongée du cœur créatif de l'équipe, le meneur de jeu Tomáš Rosický, qui manqua près de la moitié de la campagne pour cause de blessure. Malgré cette tourmente, le formidable duo d'attaquants composé du Brésilien Ewerthon et du géant tchèque Jan Koller fut à la hauteur, les deux joueurs inscrivant 16 buts chacun. L'année fut marquée par une élimination précoce et déchirante en qualification de la Ligue des Champions face au Club Bruges aux tirs au but, ainsi que par le contexte inquiétant de problèmes financiers croissants, marquant un chapitre turbulent dans l'histoire du club.