La campagne 2016-17 a offert aux Boquerones une saison de consolidation spectaculaire en milieu de tableau, Malaga terminant 11ème de La Liga. L'équipe s'est remise de manière spectaculaire d'une période turbulente sous trois entraîneurs différents, grâce à une remontée fulgurante en fin de saison sous la houlette de Míchel. Le jeune attaquant sensationnel Sandro Ramírez a mené cette charge, ses 14 buts en championnat s'avérant décisifs. Il a été le pilier de l'attaque lors d'une série de matchs qui a vu l'équipe dominer le FC Barcelone et Valence à La Rosaleda. Ce fut également une année d'adieux émouvants pour les icônes du club, Duda et Weligton, marquant un chapitre significatif et déterminant de la renaissance du club.