La saison 2012-13 fut une campagne dramatique et mouvementée pour Colchester United. Alors que les "U's" célébraient leur 75e anniversaire, ils ont mené une lutte acharnée contre la relégation en League One, obtenant finalement une 20e place vitale. La saison fut marquée par des bouleversements, dont un record du club de neuf défaites consécutives qui a conduit au limogeage de l'entraîneur John Ward. Cependant, l'arrivée de Joe Dunne a déclenché un redressement crucial en milieu de saison. Les co-meilleurs buteurs, Jabo Ibehre et Freddie Sears, ont mené l'attaque, marquant chacun 8 buts, ce qui s'est avéré décisif dans la lutte désespérée pour éviter la relégation. Ce fut une année tendue, bâtie sur la détermination et une résurgence finale qui a assuré leur maintien en League One.