La saison 2003-04 fut une saison de déception nationale et de nouvelle brillance offensive pour le Bayern Munich, le FCB terminant 2e de la Bundesliga et ne parvenant finalement pas à remporter de trophée majeur. À la pointe de l'attaque, la nouvelle recrue néerlandaise clinique, Roy Makaay, dont les 23 buts exceptionnels en championnat, sur un total de 31 toutes compétitions confondues, se sont avérés décisifs et lui ont valu le surnom de « Fantôme » de la part des fans. Sous la houlette de l'entraîneur Ottmar Hitzfeld, l'équipe, avec la puissance au milieu de terrain de Michael Ballack, fut malheureusement marquée par l'incapacité à devancer le Werder Brême pour le titre et une élimination précoce en huitièmes de finale de la Ligue des Champions face au Real Madrid. Une année au potentiel inexploité, mais qui lança le statut légendaire de Makaay.