La saison 2018-19 a vu les Gones décrocher une cruciale 3e place en Ligue 1, garantissant un retour en phase de groupes de la Ligue des Champions. L'attaque a été brillamment menée par le nouvel avant-centre, Moussa Dembélé, qui a inscrit 20 buts toutes compétitions confondues (dont 15 en championnat) lors de sa première saison, succédant à Mariano Díaz. Sous la houlette de l'entraîneur Bruno Génésio, un fait marquant fut leur parcours mémorable en Ligue des Champions, qui les a vus s'offrir une victoire surprise 2-1 contre Manchester City en phase de groupes, avant que leur aventure ne s'achève en huitièmes de finale contre Barcelone. L'année, marquée également par l'excellente forme de Memphis Depay, élu "Joueur de la saison", et scellée par le but victorieux de Dembélé dans les dernières secondes de l'inoubliable Derby contre Saint-Étienne, a marqué une saison charnière qui a prolongé la longue série de qualifications européennes du club.