La campagne 2007-08 fut une saison turbulente et pleine de suspense pour les Bolton Wanderers, les Trotters luttant pour une 16e place en Premier League, assurant de justesse leur maintien dans l'élite. L'année fut marquée par des bouleversements, débutant sous Sammy Lee et passant rapidement à l'entraîneur Gary Megson, qui mena le club à travers une lutte tendue contre la relégation. L'énigmatique Nicolas Anelka menait l'attaque, ses 10 buts cruciaux en championnat ayant donné l'étincelle initiale avant son départ très médiatisé en janvier. Malgré les difficultés nationales, le club offrit à ses fidèles supporters un parcours inoubliable jusqu'aux huitièmes de finale de la Coupe UEFA, incluant un triomphe mémorable contre l'Atlético Madrid, avant de finalement prioriser son maintien en Premier League. Cette campagne âprement disputée, avec sa gloire européenne contrastant avec l'anxiété nationale, reste un chapitre marquant de l'histoire moderne du club. La campagne 2008-09 vit les Bolton Wanderers consolider leur statut en Premier League en obtenant une 13e place sûre. La saison fut marquée par le club battant son record de transfert pour recruter l'attaquant suédois Johan Elmander et par l'émergence de talents comme Gary Cahill. L'attaquant infatigable Kevin Davies menait la charge, ses 12 buts en championnat étant cruciaux ; il égala de manière spectaculaire son meilleur total en Premier League en marquant deux fois lors de son premier match en tant que capitaine du club, une victoire mémorable 3-2 contre Tottenham Hotspur. Les Trotters connurent une solide série en milieu de saison qui assura leur position dans l'élite et reste un chapitre marquant de stabilité sous l'entraîneur Gary Megson.