La saison 2005-06 fut une saison de consolidation mouvementée pour la Triestina, les Alabardati assurant une 14e place en milieu de tableau en Serie B, naviguant avec succès une année chaotique qui vit le club changer pas moins de cinq fois d'entraîneur. L'attaquant slovène Denis Godeas fut le fer de lance de l'attaque avec des buts cruciaux, ses 9 réalisations s'avérant vitales dans une campagne bâtie sur le courage et une détermination implacable à se maintenir en deuxième division. Malgré les turbulences extra-sportives, cette saison marqua un chapitre clé de résilience sportive pour le club, qui évita confortablement les barrages de relégation. La saison 2006-07 fut une saison de lutte angoissante pour la Triestina, les Alabardati luttant désespérément pour conserver leur statut en Serie B. Le club termina à une précaire 17e place, les forçant à disputer un barrage de relégation tendu. Le milieu de terrain très technique Riccardo Allegretti fut le fer de lance, ses 6 réalisations cruciales s'avérant vitales dans une campagne bâtie sur une détermination sans faille. Malgré son excellente forme personnelle, l'année fut marquée par la lutte angoissante de l'équipe pour éviter la relégation, un chapitre déterminant dans l'histoire du club.