La saison 2014-15 fut une lutte tendue et dramatique pour la survie de l'Atalanta, La Dea terminant à une précaire 17e place en Serie A, assurant de justesse son maintien dans l'élite avec seulement trois points d'avance. Le tournant survint en mars avec l'arrivée de l'entraîneur Edoardo Reja, qui stabilisa l'équipe durant une période mouvementée et fut salué comme le sauveur du club. À la pointe de cette quête désespérée de buts se trouvait le vétéran argentin Germán Denis, dont les 8 réalisations s'avérèrent absolument vitales, notamment un mémorable but victorieux à l'extérieur contre l'AC Milan à San Siro. La saison culmina par un soupir de soulagement collectif, le maintien étant dramatiquement assuré le 10 mai par une victoire cruciale 3-2 à Palerme, marquant une bataille acharnée et inoubliable pour conserver leur place dans l'élite italienne. La saison 2015-16 apporta une période de stabilisation pour l'Atalanta, La Dea terminant à une confortable 13e place en Serie A, améliorant ainsi sa performance après la frayeur de relégation de l'année précédente. Le dynamique attaquant Papu Gómez mena l'offensive, ses 7 buts le plaçant en tête des meilleurs buteurs du club. L'année fut particulièrement émouvante, marquant la retraite de la légende du club Gianpaolo Bellini, qui conclut toute sa carrière par une dernière apparition et un but, scellant un chapitre mémorable de dévouement qui précéda la future ascension spectaculaire du club sur la scène européenne.