La saison 2005-06 fut une campagne turbulente, faite de lutte et de résilience pour Everton. Les Toffees terminèrent 11e de la Premier League, ne parvenant pas à capitaliser sur leur spectaculaire 4e place de l'année précédente. Des éliminations précoces en Ligue des Champions et en Coupe UEFA, associées à une période en zone de relégation fin octobre, mirent à l'épreuve la détermination du club avant que l'équipe de David Moyes ne se reprenne. L'attaquant James Beattie mena la charge, ses 10 buts cruciaux en championnat s'avérant vitaux pour assurer un maintien confortable en milieu de tableau. Cette saison est également tendrement remémorée comme le dernier chapitre émouvant de l'icône du club, Duncan Ferguson, dont la retraite marqua la fin d'une ère à Goodison Park. La campagne 2006-07 marqua un retour vital d'Everton sur la scène européenne. Les Toffees, sous la houlette de l'entraîneur David Moyes, décrochèrent une solide 6e place en Premier League, assurant ainsi une qualification pour la Coupe UEFA. L'attaquant Andrew Johnson, recrue record du club, ancra l'attaque avec 11 buts cruciaux en championnat, marquant notamment un doublé lors de la sensationnelle victoire 3-0 dans le derby du Merseyside contre leurs rivaux de Liverpool. Cette saison, marquée par les performances incessantes du Joueur de la Saison Mikel Arteta, a réussi à rétablir la place d'Everton parmi l'élite anglaise et reste un chapitre déterminant de l'histoire moderne du club.